L'objectif de ce travail est d'identifier les enjeux de biodiversité sur les espaces naturels protégés par le Conservatoire du littoral, de prioriser les sites sur lesquels il est urgent d'intervenir et de développer des orientations d'intervention. L'identification des enjeux s'est basée sur un état des lieux de la biodiversité connue sur les espaces littoraux naturels, réalisé à partir d'une analyse bibliographique conséquente (documents de gestion et rapports divers) puis d'une analyse qualitative (audit auprès de 118 acteurs). En raison des lacunes importantes dans la connaissance, l'identification de la valeur patrimoniale des sites s'est portée sur les habitats et les espèces remarquables présents dans les unités de gestion. 132 sites Outre-mer ont été considérés, regroupés en 52 « unités de gestion écologique ».