Résumé: Dans les eaux tropicales, généralement oligotrophes, les milieux côtiers se démarquent par l'existence d'écosystèmes particulièrement productifs comme les récifs coralliens, les herbiers de phanérogames et les mangroves. Le but de cette thèse était d'établir une cartographie fine des biocénoses marines côtières de Guadeloupe et de Martinique, en privilégiant les herbiers. En effet, à partir des cartes produites et d'études in situ une estimation de la production annuelle de cette biocénose devait être réalisée. La télédétection répondait à nos besoins d'inventaires. La cartographie a été réalisée a partir de deux types de données : des photographies aériennes en vraie couleur et des données xs du satellite spot. Les photographie numérisées répondaient a nos exigences, des objets de taille réduite et imbriques ont été relevés. La méthode d'analyse a permis de s'affranchir des problèmes de variation de turbidité. Les données xs de spot étaient, a priori, de par leur résolution et la gamme des longueurs d'ondes captées, peu adaptées. En utilisant de façon optimale l'information contenue dans les canaux xs, il a été possible de générer des documents d'une grande richesse thématique. Dans les deux cas, 32 thèmes ont été clairement identifies. Les herbiers ont été décrits en 12 thèmes. Une part de ces travaux est consacrée à l'étude des herbiers à Thalassia testudinum banks ex konig, à l'échelle du plant. Divers paramètres caractérisant le système foliaire, les rhizomes et les racines ont été mesures, une analyse sédimentaire a été effectuée. Une typologie des herbiers a été établie. La production de feuilles a été mesurée in situ. Cette méthode a permis d'établir la très forte production des herbiers de ces iles. La production globale a été estimée en intégrant les données de la télédétection (surface, densité, type de sédiment) et les études menées in situ. Les 13 200 ha d'herbiers cartographies produisent 76 300 t (ps) par an. Les herbiers représentent une biomasse de 156 000 t (ps). Cette étude a permis de générer des documents cartographiques qui établissent une référence quand à l'état actuel des biocénoses marines côtières. Ces cartes thématiques fournissent une base de travail pour les scientifiques. Les décideurs locaux pourront eux aussi s'inspirer de ces documents pour des aménagements futurs.